Aos 36 anos, Matías Fernández deixa os relvados. O médio ofensivo, conhecido como Matigol, fez toda a formação no Colo-Colo antes de se estrear pela equipa principal, com um jogo em 2003. Em 2004, com 18 anos, assumiu-se como titular, jogando pelo clube até 2006, somando 37 golos em 82 partidas, vencendo um Torneio Abertura, um Clausura e uma Taça do Chile. Seguiram-se três épocas no Villarreal onde nunca foi figura central mas conseguiu somar 7 golos em 71 partidas. Nada venceu em Espanha e nada venceria em Portugal.

Chegaria ao Sporting em 2009 para três boas épocas a nível individual e uma a nível coletivo. Nessa última, foi figura de monta na campanha europeia que deixou Lázio e Manchester City pelo caminho, marcando um grande livre em Manchester. Fez 12 golos em 69 partidas e seguiu para Itália. Em Florença, passou quatro anos, com um empréstimo ao Milan pelo meio. Pela Fiorentina, 7 golos em 96 jogos. Pelo Milan, 1 golo em 13 jogos e venceu a Taça de Itália, primeiro trofeu em dez anos e primeiro e único na Europa, curiosamente na equipa onde menos importância teve.

Passaria depois pelos mexicanos do Necaxa (dois títulos locais), pelos colombianos do Junior Barranquilla antes de regressar ao Colo-Colo. Terminou a carreira com duas épocas no modesto La Serena. Fez 14 golos em 74 jogos pelo Chile, tendo vencido a Copa América de 2015.